Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm42488-201ENSMUST00000197648 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccbe1Q3MI99 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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