Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms