Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vps8Q0P5W1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps8Q0P5W1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms