Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cntn3Q07409 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cntn3Q07409 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms