Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pde1bQ01065 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pde1bQ01065 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pde1bQ01065 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pde1bQ01065 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pde1bQ01065 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Pde1bQ01065 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pde1bQ01065 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pde1bQ01065 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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