Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoa1Q00623 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms