Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pou1f1Q00286 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pou1f1Q00286 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms