Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
RhodP97348 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
RhodP97348 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
RhodP97348 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
RhodP97348 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms