Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Arf1P84078 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Arf1P84078 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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