Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tubg1P83887 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms