Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SgcdP82347 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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