Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Arf6P62331 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms