Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Vbp1P61759 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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