Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn18P56857 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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