Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Irf5P56477 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Irf5P56477 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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