Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Sh3bp1P55194 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sh3bp1P55194 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sh3bp1P55194 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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