Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PtpreP49446 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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PtpreP49446 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PtpreP49446 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms