Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gbx2P48031 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gbx2P48031 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gbx2P48031 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms