Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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