Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VhlP40338 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VhlP40338 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms