Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
ThpoP40226 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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