Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab17P35292 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab17P35292 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms