Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Usp4P35123 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp4P35123 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms