Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hoxc11P31313 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hoxc11P31313 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Hoxc11P31313 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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