Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC103672.1-201ENSMUST00000227502 365 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd10P28359 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Hoxd10P28359 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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