Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pou3f1P21952 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms