Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NelfeP19426 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms