Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Sptan1P16546 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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