Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Vpreb1P13372 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms