Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
DmdP11531 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ighv1-8-201ENSMUST00000192236 293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm3198-201ENSMUST00000208725 1026 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
DmdP11531 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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DmdP11531 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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DmdP11531 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm28653-202ENSMUST00000227082 521 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DmdP11531 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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