Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
BckdkO55028 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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