Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

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Length 1,769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tubgcp6G5E8P0 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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