Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
H2-M1F7CXU4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms