Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vmn2r40F6W043 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms