Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Atf6F6VAN0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms