Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprbB2RU80 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprbB2RU80 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprbB2RU80 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprbB2RU80 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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