Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Znf518aB2RRF6 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Znf518aB2RRF6 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms