Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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