Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ubl3Q9Z2M6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ubl3Q9Z2M6 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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