Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Crlf3Q9Z2L7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms