Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gpc1Q9QZF2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms