Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Thsd1Q9JM61 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Thsd1Q9JM61 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Thsd1Q9JM61 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Thsd1Q9JM61 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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