Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rabgef1Q9JM13 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Rabgef1Q9JM13 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Rabgef1Q9JM13 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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