Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Col5a3Q9JLI2 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col5a3Q9JLI2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Col5a3Q9JLI2 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Col5a3Q9JLI2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms