Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tgm1Q9JLF6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tgm1Q9JLF6 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms