Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc17Q9CXD9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lrrc17Q9CXD9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Lrrc17Q9CXD9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Lrrc17Q9CXD9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms