Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms