Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tdrd1Q99MV1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tdrd1Q99MV1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms