Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx11Q91WL6 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx11Q91WL6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms