Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Usp27Q8CEG8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms